Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp39Q3TIX9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp39Q3TIX9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp39Q3TIX9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp39Q3TIX9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp39Q3TIX9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms