Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd11Q1RNF8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms