Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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