Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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