Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms