Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms