Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms