Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms