Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms