Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms