Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39Q06138 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms