Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc2Q05020 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms