Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms