Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms