Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms