Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms