Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnb1Q02248 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnb1Q02248 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms