Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms