Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms