Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms