Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms