Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Il6stQ00560 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il6stQ00560 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms