Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
F8a1Q00558 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
F8a1Q00558 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms