Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nbr1P97432 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms