Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Usp9xP70398 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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