Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeboxP70368 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms