Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms