Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms