Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp7P70280 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp7P70280 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms