Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1P63239 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1P63239 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1P63239 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1P63239 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1P63239 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcsk1P63239 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms