Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ufm1P61961 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ufm1P61961 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ufm1P61961 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ufm1P61961 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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