Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf13P61216 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms