Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CirbpP60824 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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