Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms