Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P58686 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P58686 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
P58686 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P58686 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms