Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cldn18P56857 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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