Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms