Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms