Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox5P52651 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox5P52651 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms