Protein–RNA interactions for Protein: P50431

Shmt1, Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt1P50431 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt1P50431 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms