Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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