Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkn1bP46414 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms