Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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