Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms