Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtlP38585 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtlP38585 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtlP38585 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms