Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PpargP37238 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PpargP37238 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PpargP37238 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PpargP37238 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PpargP37238 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PpargP37238 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PpargP37238 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PpargP37238 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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PpargP37238 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PpargP37238 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PpargP37238 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PpargP37238 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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PpargP37238 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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