Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin1P35438 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin1P35438 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms