Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mmp13P33435 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mmp13P33435 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mmp13P33435 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mmp13P33435 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mmp13P33435 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mmp13P33435 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mmp13P33435 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mmp13P33435 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mmp13P33435 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mmp13P33435 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mmp13P33435 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mmp13P33435 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mmp13P33435 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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