Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprmP28828 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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