Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms